今日聚焦!【病毒学技术】基于二代测序技术建立覆盖我国主要流行亚型的HIV-1近全长基因组测序方法
(资料图)
【病毒学技术】基于二代测序技术建立覆盖我国主要流行亚型的HIV-1近全长基因组测序方法
近日，中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心和河北医科大学公共卫生学院的研究人员利用二代测序技术，成功建立了一种适合我国主要流行亚型的HIV-1近全长基因组扩增和测序方法，并优化建立标准检测流程，其中测序数据使用病原微生物信息分析系统（北京微未来公司）进行自动整理、拼接和分析。这为为HIV-1的全基因组序列鉴定和相关系统进化分析等应用提供重要技术手段。
本研究基于我国HIV-1主要流行亚型设计扩增引物，通过扩增两段交叉重叠的基因序列获得HIV-1近全长基因组。并通过使用不同反转录试剂与扩增试剂以及尝试不同反应体系和反应条件，分析对HIV-1近全长基因组扩增的效果以及进行二代测序所获序列质量的影响。结果显示基于二代测序技术建立的HIV-1近全长基因组扩增和测序方法可成功扩增我国主要HIV-1流行亚型CRF01＿AE、CRF07＿BC、CRF08＿BC、B、CRF55＿01B，进行二代测序所获基因组序列的平均比对率为95.18%(89.74%～99.16%)，平均覆盖率为94.96%(83.58%～99.98%)，平均测序深度为5323.10×（3026.68×～6790.57×）。
进一步分析不同亚型毒株每个基因位点的测序深度覆盖图，发现CRF08＿BC亚型与CRF105＿0108亚型的毒株测序深度分布均匀，均高于6000×，其他亚型的毒株样本在6672～8196 bp之间有部分基因位点的测序深度较低。优化和建立的标准检测流程可成功扩增病毒载量大于104copies/mL的样本并获得准确的近全长基因组序列。
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2023-06-04 经观快讯
环球快资讯：高考在即，北京民警给考点执勤保安开展应急处突培训
2023-06-04 新京报
神舟十五号航天员乘组平安抵京-世界热闻
2023-06-04 新华社新闻
marni中国官网_marni是什么牌子
2023-06-04 互联网
北岳恒山突发山火！景区停止售票-环球简讯
2023-06-04 北京日报
vmware安装失败怎么解决_VMware虚拟机安装失败 出现如图错误 天天报道
2023-06-04 互联网
洛阳景点排行榜_洛阳景点推荐 当前要闻
2023-06-04 互联网
天天百事通！原神xp是什么意思梗_xp什么意思什么梗
2023-06-04 互联网
6月5日上午9点！来滨河公园参与环境日活动呀～
2023-06-04 昌平圈
中外青年“打卡”北京城市副中心 探寻高质量绿色发展奥秘
2023-06-04 中青网新闻派
高考在即，西城警方开展安全检查处突培训 全球微头条
2023-06-04 北京日报客户端
财务经理面试技巧和注意事项怎么写_财务经理面试技巧和注意事项-环球实时
2023-06-04 互联网
当前焦点!10万尾鱼苗跃进小秦淮河“小鱼治水”守护古城水环境
2023-06-04 扬州发布
辽宁省政法系统党风廉政建设工作会议召开
2023-06-04 东北新闻网
全球百事通！假奶粉跟真奶粉的区别_辨别真假步骤学会了么
2023-06-04 互联网
车辆紧急召回！涉及这些品牌_每日消息
2023-06-04 百度新闻
北京延庆召开低碳/零碳产业园区建设路径研讨会_世界观焦点
2023-06-04 中国科学报
壮丽！北京三号卫星真三维实景带你云游苍山洱海-环球今热点
2023-06-04 大理电视台
世界球精选！禁止施工噪声、部分公交绕行.....北京5项措施确保高考顺利进行
2023-06-04 北京青年报官网
速读：丰富全民健身赛事品类 北京举办儿童卡丁车系列赛
2023-06-04 北京日报客户端
【世界报资讯】郑州中考时间2023年时间表
2023-06-04 初三网
安全顺利出舱！“感觉良好”×3！现场视频→
2023-06-04 央视新闻
【独家】皮箱尺寸图片参照物（皮箱尺寸）
2023-06-04 互联网
快播：全面生效！
2023-06-04 21世纪经济报道
黑海岸哪个方向是去秘蓝岛_黑海岸哪里坐船
2023-06-04 互联网
每日聚焦：不满意交通事故责任认定要怎么办
2023-06-04 法师兄
世界新资讯：EDG暂停惹争议，LPL迎灾难级回溯，Meiko地位不保，解说彻底崩盘
2023-06-04 天下游戏汇
“砰——砰——砰”三声脆响，话剧《玩家》迎来百场演出-全球今头条
2023-06-04 澎湃新闻
北京怎么这么多高收入？我告诉你他们都是干啥的|世界快资讯
2023-06-04 章哥说买房
环球热讯:注意防晒！北京今日最高气温33℃
2023-06-04 北京时间
瓜类今夏普遍涨价？上半年气候不稳定为主因 天天动态
2023-06-04 极目新闻
微控制器实时操作系统实践1实时系统介绍|全球快资讯
2023-06-04 博客园
清蒸小黄花鱼的家常做法（小黄花鱼的家常做法） 焦点热文
2023-06-04
英国政府拟仿照IAEA在伦敦设全球性AI监管机构 天天快讯
2023-06-04 和讯崔晨
Akasa为英特尔NUC13ProArenaCanyon无风扇配备全新高级外壳和适用于AMDRyzen的铜冷却_焦点热文
2023-06-04 互联网
【全球速看料】山东日照：“三夏”时节麦收忙
2023-06-04 人民网－山东频道
懂中文的印尼大学生走俏中企招聘会
2023-06-04 中国新闻网
环球视点！纳米比亚政党人士：美西方拱火浇油 激化俄乌冲突
2023-06-04 央视新闻客户端
591岁！全国最老龙舟出水
2023-06-04 新华社
环球快播：女王的英语怎么读音 女王的英文怎么读音
2023-06-04 城市网
福特Ranger明年将首次亮相插电式混合动力系统
2023-06-04 万能网
阿斯顿·马丁DB12将6月12日国内首发
2023-06-04 搜狐科技
天天简讯:綦江区气象局发布暴雨黄色预警【Ⅲ级/较重】【2023-06-04】
2023-06-04 九派新闻
高考快到了内卷的不只是“糕粽”餐饮店吆喝吉祥饭 快报
2023-06-04 扬州日报-扬州网
环球热点！连云港人口为什么增加流入还是流出海州区有多少
2023-06-04 壹壹高考网
丰田反对电动车：建议别反对|当前最新
2023-06-04 ZAKER科技
热文：小米推出20万份高考加油包 覆盖2000考点 考生免费领
2023-06-04 CNMO手机中国
迪士尼官方称将落户武汉是假新闻 武汉网友白高兴了 环球快资讯
2023-06-04 CNMO手机中国
比亚迪稳居第一 理想杀至第二 5月中国车企市值榜公布-焦点热门
2023-06-04 CNMO手机中国
比亚迪突然上调车辆保养价格 部分车型涨幅达50%
2023-06-04 CNMO手机中国
618换机怎么选？荣耀90系列或是终极答案 2499元起 世界快资讯
2023-06-04 CNMO手机中国
【天天新要闻】陈太丘与友期行选自世说新语的哪一篇_世说新语陈太丘与友期行原文及翻译
2023-06-04 互联网
RNG八人确诊是怎么回事（RNG八人确诊事件介绍）
2023-06-04 互联网
早安北京0604：最高33℃；五项措施发布，确保高考顺利进行|今日报
2023-06-04 新京报
罗马诺：米兰计划周日向伊布告别，他将在未来几天决定自己的未来|全球观察
2023-06-04 直播吧
2023高考倒计时3天！祝福每一位考生_环球速看
2023-06-04 长江云
官宣!阿扎尔遭皇马提前解约 4年7球8冠!或将退役
2023-06-04 网易体育
【世界新要闻】美想把俄罗斯肢解成43个国家，又有一个担心，怕中国借机控制远东
2023-06-04 刘勇教授
国内首台特高压直流高速开关研制成功 当前滚动
2023-06-04 中国产业经济信息网
可以像纸一样弯曲！我国研制出高柔韧性单晶硅太阳电池_全球热文
2023-06-04 中国产业经济信息网
养殖工船开向深远海新一代15万吨级智慧渔业大型养殖工船启动建造
2023-06-04 中国产业经济信息网
环球今日讯！中国铁建中标全国首个“投建营”一体化设计铁水联运项目
2023-06-04 中国产业经济信息网
全球在建规模最大海拔最高光伏电站开工|世界今日讯
2023-06-04 中国产业经济信息网
俄罗斯用什么货币换人民币（俄罗斯用什么货币） 全球焦点
2023-06-04 互联网
焦点要闻：关于名胜古迹的古诗手抄报
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环球即时看！6月继续嗨起来！滨城这儿旅游消费月启动
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每日速递：《区域全面经济伙伴关系协定》对15个签署国全面生效——RCEP进入全面实施新阶段
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还没告诉你对不起我爱你是哪个电视剧 还没告诉你对不起我爱你 视讯
2023-06-04 互联网
肃的笔顺 世界热点评
2023-06-04 城市网
环球新消息丨钹读音 钹
2023-06-04 城市网
世界速讯：刚刚，马斯克私人飞机已离开上海！访华超40小时，马斯克夺回“世界首富”头衔
2023-06-04 每日经济新闻
皇马官方：经过协商，阿扎尔提前解约离队
2023-06-04 体坛+
白夜极光攻略大全，新手卡池抽什么-天天快资讯
2023-06-04 哔哩哔哩
【战争雷霆-节日纪念】加拿大武装部队纪念日贴花与载具返场活动
2023-06-04 哔哩哔哩
三国志战略版最稳春哥盾，白板硬刚五队满红!
2023-06-04 哔哩哔哩
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2023-06-04 万能网
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2023-06-04 互联网
北京部分公交专用车道已对社会车辆开放
2023-06-04 爱卡汽车
公交专用道开放首个周末交通路网平稳-世界时讯
2023-06-04 北京青年报官网
华为（北京）虚拟现实 创新中心落户石景山 今日讯
2023-06-04 北京青年报官网
无法连接game center服务器
2023-06-04 互联网
奇瑞TIGGO瑞虎9全球上市，15.29万元起售价惊喜超值
2023-06-04 速度计
火爆网络 小姐姐等疯狂展示的“多巴胺”穿搭真会让人快乐吗？专家释疑
2023-06-04 快科技
世界观热点：董璇包场为女儿庆生，与高云翔一起切蛋糕不计前嫌，更多全家福曝光
2023-06-04 新浪娱乐
环球微头条丨连坐之罪是什么意思-连坐是什么意思
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【世界聚看点】五行健康操高清下载_五行健康操mp4下载
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崇太长江隧道完成明挖段围护结构施工
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观点：37℃！高考期间温度保持在……
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2023-06-04 车百科
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